De to mennene, som er 33 og 46 år gamle, ble pågrepet av politiet tirsdag kveld.
- Jeg kan bekrefte av vi har pågrepet to menn som er siktet for forsettelig drap, sier politiadvokat Kaare Songstad i Hordaland politidistrikt til NRK.
Den 33 år gamle mannen som er siktet, er Trine Frantzens tidligere samboer. I følge advokaten hans, Jørgen Riple, innrømmer han ikke straffskyld.
- Han har vært ganske klar på at dette har han ikke gjort, og han vil samarbeide med politiet for å forsøke å sjekke seg selv ut av saken, sier advokat Riple.
Advokaten skal nå sette seg inn i saken før 33-åringen blir avhørt av politiet. Avhør kan ifølge Riple skje i løpet uken.
Begge blir trolig fremstilt for varetektsfengsling fredag, i følge politiadvokat Kaare Songstad.
Sporløst forsvunnet
Frantzen har vært sporløst forsvunnet siden mai 2004. Politiet har ikke funnet noe lik.
- Det er skjellig grunn til mistanke om at de har hatt noe med drapet og fjerningen av liket å gjøre, sier Songstad.
Han vil ikke gå nærmere inn på hvem disse personene er, men bekrefter at de har vært i det samme rusmiljøet i Bergen som Trine Frantzen hørte til.
Hjelp av Ola Thune
Politiet har lenge slitt med å finne svar på hva som skjedde med den 32 år gamle kvinnen fra Os, som sist ble sett i live i Fana i Bergen 7. mai 2004.
I slutten av oktober i fjor opprettet politiet et ekspertteam som skulle etterforske saken på nytt.
Noe av bakgrunnen for dette var privatetterforsker Ola Thunes bidrag i etterforskningen av saken gjennom programmet 'Savnet' på TV Norge.
I januar i år har politiet lett med hunder og søkt med dykkere i området med den siste observasjonen av Trine Frantzen - men uten å finne noe lik.
25. januar utlovet familien til Trine Frantzen en dusør på 250 000 til den som kom med tips som gjorde at hun ble funnet.
- Vi vil ha en grav å gå til, det er veldig viktig, sa mor Bente Frantzen til NRK den gang.