Styrker fra Al-Shabaab angrep i ettermiddag presidentpalasset med granater og skytevåpen, melder nyhetsbyrået AFP.
Meldinger går ut på at opprørerne klarte å komme seg helt inn på presidentens kontor etter en lengre skuddveksling med sikkerhetsvakter.
President Hassan Sheikh Mohamud skal imidlertid ha klart å komme seg uskadd unna, og befinner seg i sikkerhet hos den fredsbevarende styrken fra Den afrikanske union, AMISOM.
Ni angripere ble drept, ifølge en offisiell tjenestemann. Det er ikke klart hvor mange av presidentens vakter som ble drept.
– Det var åtte eksplosjoner mot slutten av angrepet, sannsynligvis selvmordsvester. De sprengte seg selv i luften, sier en talsmann for sikkerhetsstyrkene, Abdi Ahmed, til nyhetsbyrået AFP.
Det er andre gang i år at Al-Shabaab angriper presidentpalasset. I februar startet opprørerne et tilsvarende angrep, også da uten å få tak i presidenten.
- Les også:
Tredje angrep på kort tid
Angrepet på presidentpalasset er det andre store angrepet i Mogadishu på kort tid.
Lørdag sprengte en selvmordsbomber fra Al-Shabaab seg i luften nær parlamentsbygningen i hovedstaden. Minst fire personer – blant dem to politifolk, ble drept i angrepet.
– Vi drepte mer enn et dusin såkalte politifolk i et angrep ved hovedinngangen til parlamentsbygningen. Vi vil si ifra om at parlamentsmedlemmer ikke er trygge noe sted i Mogadishu, sa Al-Shabaab-talsmann Abdulaziz Abu Musab etter lørdagens angrep.
Tidligere i forrige uke ble parlamentarikeren Ahmed Mohamud Hayd, også det av Al-Shabaab.
Den tidligere ministeren ble drept i et tungt politibevoktet område i byen.