FFK solgte mandag Amin Askar til Brann. Nå forsvinner også Thomassen fra Østfold-klubben.
Ifølge f-b.no ble klubbene enige mandag kveld. Overgangssummen skal være mellom 1,3 og 1,6 millioner kroner.
– Joachim er en spiller vi har fulgt lenge og som vi er veldig glade for å ha fått muligheten til å hente nå, sier Vålerenga-manager Martin Andresen til klubbens nettsted.
Besto den medisinske testen
Thomassen besto tirsdag en medisinsk test og skrev under en fireårskontrakt. Han kan få sin debut i La Manga Cup mot Dnipro onsdag.
Thomassen har spilt for Fredrikstad siden 2008. Han kom opp i 65 eliteseriekamper og to mål.
23-åringen startet karrieren som midtbanespiller, men er blitt flyttet ned på venstrebacken i senere år.
Thomassen hadde ett år igjen av sin kontrakt med FFK.Fredrikstad sliter voldsomt økonomisk.