Områdene som ble angrepet av krigsfly, ligger i nærheten av byen Karabilah på grensen til Syria.
Operasjonen pågår for tredje dag på rad, ifølge det amerikanske forsvaret, som mener utenlandske opprørere tar seg inn i Irak via grensen til Syria.
Mange drept
Samtidig gjennomførte omkring 1.000 irakiske og amerikanske styrker i fellesskap en dobbel offensiv i den svært urolige provinsen Al-Anbar vest i Irak. Over 50 opprørere skal være drept i denne operasjonen siden den ble innledet sist fredag.
Samme dag ble fire irakiske soldater drept og minst tolv såret i et selvmordsangrep i Saddam Husseins fødeby Tikrit.
Angrepet skjedde utenfor et av palassene som ble bygd av den styrtede diktatoren, men som nå huser en amerikansk militærbase.
Tikrit, som ligger 18 mil nord for Bagdad, har opplevd stadig flere selvmordsangrep de siste månedene.
I Bagdad ble minst to mennesker drept og 15 såret i et bilbombeangrep mot en irakisk politikolonne nær en sjiamuslimsk moské i Bagdad, ifølge en kilde i innenriksdepartementet.