Mannen i 20-årene har jobbet på SFO ved to skoler i Bergen.
Politiet fikk melding fra en av skolene om at mannen trolig hadde forgrepet seg på flere av barna onsdag ettermiddag.
Dagen etter ble han pågrepet, siktet for voldtekt av flere barn under 14 år.
– Det er en veldig alvorlig siktelse med flere fornærmede. Vi har store ressurser på saken, for å forsøke å finne ut hva som har skjedd, sier politiadvokat Elisabeth Bru.
Bergens Tidende omtalte siktelsen først.
Lørdag formiddag ble mannen varetektsfengslet i fire uker i Hordaland tingrett, med brev- og besøksforbud de to første ukene.
Ikke oversikt over fornærmede
Det er flere fornærmede barn i saken, men Bru ønsker ikke å gå inn på hvor mange det er.
Politiet har heller ikke full oversikt over antallet på nåværende tidspunkt.
Foreldrene til barna ved de to skolene er ikke varslet.
– Det vil bli gjennomført et møte med alle foreldrene ved den ene skolen lørdag, sier Bru.
Forsvarer: – Innser at han har et problem
Mannens forsvarer, advokat Erik Johan Mjelde, sier at mannen har forklart seg grundig til politiet, og at han erkjenner delvis straffskyld.
– Han innser at han har et problem, og ønsker behandling.
Etatsdirektør Frode Nilsen for skole i Bergen kommune kan ikke opplyse om hvor lenge mannen har vært ansatt ved de to bergensskolene.
– Vi kommenterer ikke ansettelsesforhold til noen av våre ansatte, sier Nilsen.
Han understreker at alle som ansettes i Bergen kommune må ha politiattest.