Mannen det gjelder, er ikke identifisert. Han vil ha 12 timer på å anke avgjørelsen.
Israel har tidligere fått kraftig internajsonal kritikk for planene om å flytte slektninger av selvmordsbombere fra Vestbredden til Gazastripen i et forsøk på å hindre nye terrorangrep.
Det er det israerlske sikkerhetsrådet som har besluttet at slektningen skal deporteres.