Angrepet skjedde sent lørdag kveld.
De tre pågrepne som ble drept, var pågrepet fordi de var mistenkt for å ha utplassert en annen bombe.
Politiet hadde kjørt inn i et boligområde for å inspisere en bombe som var funnet der. De hadde akkurat avsluttet arbeidet med å desarmere den, da en annen bombe eksploderte.
– Idet de forlot stedet, ble en bombe like ved kjøretøyet deres utløst, sa Kandahars politisjef Abdul Raziq.
Seks andre politifolk og en arrestant som satt i bilen som kom bak ble skadd i angrepet.
Dette er det tredje angrepet på afghansk politi i løpet av et døgn.
Tidligere på dagen ble ti mennesker drept i byen Kunduz nord i Afghanistan, to mennesker ble drept i et angrep i den østlige Ghanziprovinsen.