– Det er viktig for meg å være her i dag, sa Macron til den lokale TV-stasjonen BFM, da han så på hærverket mot de jødiske gravstedene.
Han lovet at slikt ikke skal få skje ustraffet. Macron sa at han var der for å vise det jødiske samfunnet i den lille byen Quatzenheim respekt.
Skjendingen av gravene i Alsace, nær grensen til Tyskland, skjedde natt til tirsdag.
Demonstrasjoner over hele Frankrike
President Macron besøkte Holocaust-minnesmerket i Paris tirsdag kveld. Mange franske politiske ledere sluttet seg til tusenvis av demonstranter i hovedstadens gater. Protestene ble holdt på Place de la République og var én av 70 markeringer over hele landet mot økt antisemittisme.
14 franske partier stod bak initiativet.
Partiet til Marine Le Pen, Nasjonal samling (RN), på ytterste høyre fløy i fransk politikk, ble ikke invitert. I en uttalelse fra partiet står det at de skulle ha egne markeringer.
Økt antisemittisme
I en pressemelding fra presidentpalasset heter det at antisemittiske handlinger har økt betydelig i det siste. Det ble registrert 541 slike lovbrudd i 2018.
Det er en markert økning fra året før, da det var 311 antisemittiske lovbrudd.
Forfatter hetset
Lørdag måtte fransk politi gripe inn for å beskytte den fransk-jødiske forfatteren Alain Finkielkraut fra en gruppe demonstranter i Paris.
Det ble tatt videoer av at demonstrantene, som bar gule vester, ropte «skitne sionist», «vi er folket» og «Frankrike er vårt», til forfatteren.
– Den antisemittiske hetsen han ble utsatt for strider mot alt som gjør oss til et storslått land, skrev Macron på Twitter om den opprinnelige polakken Finkielkraut, som nå er fransk statsborger.
Og fredag i forrige uke ble bilder av den franske politikeren, Simone Veil, malt over med hakekors. Den tidligere franske helseministeren og president for EU-parlamentet, var en overlevende fra Holocaust.
Dypt forankret i samfunnet
I Frankrike er det bosatt 550,000 jøder, som er den største andelen av befolkningen etter Israel og USA.
– Antisemittisme er dypt forankret i det franske samfunnet. Vi liker å tenke at det ikke er slik, men det er et faktum. Vi er nødt til å være bestemte når vi kjemper mot den, samtidig som vi er oppmerksomme på at dette er en svært gammel konflikt som vil vare lenge, sier statsminister Édouard Philippe, til nyhetsmagasinet L'Express.
En rabbi og tre barn ble skutt og drept av en islamist ved en jødisk skole i Toulouse i mars 2012.
Fire ble drept da et supermarked for kosher-mat ble angrepet av militante islamister under en gisselaksjon i Paris januar 2015.