Over 70 brannmenn ble satt inn i slukningsarbeidet i moskeen sør i London lørdag.
Politiet holder de to guttene i varetekt, skriver avisen The Guardian.
Ilden herjet hovedsakelig en administrasjonsbygning, mens selve bønnerommet i moskeen var intakt etter brannen.
Omtrent 50 prosent av første etasje ble skadet, samt deler av andre etasje og taket, skriver BBC.
En mann i 40-årene ble brakt til sykehus etter å ha pustet inn røyk.
Kun et fåtall mennesker var inne i moskeen da brannen startet. Bygningen ble straks evakuert.
Det ble varslet om brannen i 13-tiden norsk tid. Ikke før 17:30 var brannen under kontroll.
Baitul Futuh skal være den største moskeen i Vest-Europa. Den er stor nok til å huse 10.000 mennesker fordelt på tre store rom, skriver Sky News.
Landemerke
Bydelrådsleder Stephen Alambritis beskriver moskeen et viktig landemerke for området.
– Skadene på det vakre bygget er et sjokk for samfunnet, sier han.
Alambritis legger til at bygget er bemannet med sikkerhetsvakter.
Parlamentsmedlem Siobhain McDonagh er representant for bydelen. Hun var sjokkert da hun snakket med The Guardian.
– Moskeen betyr mye for det lokale samfunnet. De samler stadig inn penger til veldedighet, både til deres egne veldedighetsorganisasjoner og organisasjoner ellers i samfunnet, sier McDonagh.
- Les også: