De to andre siktede omtales som «kriminelle hackere» av USAs justisdepartement, som onsdag kunngjorde siktelsen.
Ifølge assisterende statsadvokat Mary McCord er det grunn til å tro at de to agentene har handlet på vegne av sin arbeidsgiver.
500 millioner Yahoo-brukere er berørt av datainnbruddet, ifølge amerikanske myndigheter.
Vinning og spionasje
I siktelsen knyttes den russiske sikkerhetstjenesten FSB til ett av de største dataangrepene noensinne. Motivet hevdes å ha vært økonomisk vinning og spionasje. Datainnbruddet skjedde i 2014. Det rammet blant annet epostkontoene til russiske og amerikanske embetsfolk, russiske journalister og ansatte i en rekke virksomheter.
De to FSB-agentene er identifisert som Dmitrij Dokutsjaev og Igor Susjtsjin. De to anklages for å ha beskyttet, lagt føringer, tilrettelagt og betalt kriminelle hackere for å samle informasjon ved å trenge seg inn i datasystemer i USA og andre steder.
Amerikanske myndigheter mener også at de betalte hackerne Aleksej Belan og Karim Baratov for å gjøre datainnbrudd og samle inn informasjon.
Stort angrep
De siktede angrep Yahoo-kontoene til russiske og amerikanske regjeringsansatte, deriblant personell innen datasikkerhet, diplomati og militæret, sa en representant for justisdepartementet, Mary McCord, på en pressekonferanse onsdag.
Hun opplyste også at Baratov ble pågrepet i Canada denne uken, mens det foreløpig ikke foreligger informasjon om de andre siktede.
Dataangrepet mot Yahoo ble først avslørt i fjor. Det er ett av de største datainnbruddene noensinne, og det har vært mistanke om at en statlig aktør står bak.