Toget var på vei fra Nice ved den franske rivieraen til Digne-les Bains inne i landet da det traff to steiner som lå på skinnegangen og sporet av.
En av de omkomne skal være en russisk kvinne, melder Nicematin.
I tillegg de to døde er én person alvorlig skadet. Åtte personer, blant dem togføreren har pådratt seg lettere skadet.
Totalt var det 34 personer om bord i toget da det sporet av.
Store mengder redningspersonell er nå på stedet. Ifølge nyhetsbyrået AFP er 110 brannmenn ved ulykkesstedet, i tillegg til to helikoptre.
Se twitterbilde av toget etter avsporingen.
Hang fast i trærne
Ulykken skjedde på strekningen mellom landsbyene Annot og Saint-Benoît.
Nicematin skriver at en vognene skled nedover skråningen ved ulykkesstedet, men ble holdt igjen av trærne.
Kjent turistattraksjon
Toget fra Nice til Digne-les-Bains er en kjent turistattraksjon i Sør-Frankrike.
Linjen ble bygget i 1891 og går mellom høye fjell i de franske alper.
Noen steder krysser toglinjen over 1000 meter dype kløfter på jernbanebroer.
Andre ulykke på under ett år
Det er den andre dødsulykken på franske jernbaner under ett år som skyldes at et tog har sporet av.
I juli i fjor mistet seks personer livet da et tog sporet av inne på stasjonen i Brétigny-sur-Orge, cirka tre mil sør for Paris.
- Les også: