Stoffet dietylenglykol finnes i tannkremen Tri Leaf Spearmint som deles ut gratis på spanske sykehus, opplyser kommisjonen.
Dietylenglykol kan forårsake nyre- og leverskader, og i større doser nevrologiske skader som i noen tilfeller ender med døden.
I Panama ble stoffet brukt i en hostesaft, som ble trukket tilbake i oktober i fjor.
Dagens alarm i Europa er den siste av flere om farlige kinesiske varer. På fjorårets "svarteliste" fra EUs produktsikkerhetsbyrå Rapex var 48 prosent av varene importert fra Kina, melder SVT.
Tannkremen på de spanske sykehusene er den første produktet med det giftige stoffet som er oppdaget i Europa.
Samarbeidsavtale
Kina og EU ble i fjor enige om å samarbeide om å få fjernet helseskadelige kinesiske produkter fra verdensmarkedet.
Meningen med avtalen var å sørge for at myndighetene reagerer raskt når det blir oppdaget farlige varer, og å få bukt med forfalskninger av kinesiske produkter.