Drapet skjedde sent onsdag kveld idet Erkinbajev kom hjem til boligen sin, opplyser innenriksminister Murat Sutalinov.
Den drepte var en av Kirgisistans rikeste menn, og han skal ha vært en aktiv støttespiller til den folkelige revolusjonen i mars som førte til at president Askar Akajev måtte gå av, melder NTB.
Han har også vunnet flere medaljer i kampsport, og var nå sjef for Kirgisistans olympiske komité.
Tidligere i år kunngjorde han at han ville stille som presidentkandidat, men etter et drapsforsøk i april, trakk han kandidaturet.