– Vi rekker så vidt å komme oss om bord i flyet, sa pave Frans idet han forlot Tacloban.
Like etter at pavens fly lettet, ble et annet fly regelrett blåst av rullebanen.
Flyet som fraktet høytstående myndighetspersoner rundt den filippinske presidenten Benigno Aquino, var på vei ut til rullebanen da kraftig vind tok tak i flyet slik at nesehjulet havnet i gjørma utenfor rullebanen.
Ingen ble skadet i den dramatiske hendelsen som ifølge en AFP-reporter på stedet skjedde bare en halvtime etter at pavens fly lettet.
Kvinne døde da stillas raste sammen
Pave Frans sa han lenge hadde planlagt en reise til de tyfonrammede områdene.
Han fikk akkurat holdt en messe foran titusenvis av troende i sterk vind og kraftig regn. En kvinne skal ha mistet livet da et stillas nær scenen kollapset, ifølge lokale medier.
Paven skulle etter messen egentlig besøkt overlevende fra tyfonen, men måtte forlate Tacloban fire timer tidligere enn planlagt.
– Jeg er lei for dette, virkelig lei meg, for jeg hadde forberedt noe spesielt for dere, unnskyldte paven seg ifølge BBC.
Den tropiske stormen Mekkhala har en vindstyrke på 130 kilometer i timer, og er ventet å treffe land senere på lørdag.
En million hjemløse
Bakgrunnen for besøket er å minnes de rundt 8.000 ofrene for tyfonen Hayan som rammet øya i november 2013. En million er fortsatt hjemløse.
- Les også: Bildene som ikke vil forsvinne
Tacloban ble svært hardt rammet av tyfonen Haiyan for et drøy år siden.
Pavens besøk til Filippinene, der over 80 millioner er katolikker, er del av en seks dager lang Asiareise.
Tyfonen Haiyan er den kraftigste stormen som noen gang er registret over land, og den raserte rundt 90 prosent av byen Tacloban og over 14,5 millioner mennesker i seks regioner ble rammet. Rundt en million er fortsatt hjemløse.