Kildene sier Indias Jaswant Singh og Pakistans Abdul Sattar møttes på hotellet de bor på i Katmandu.
En indisk talskvinne benekter imidlertid møtet.
- Det har ikke vært noe separat eller betydelig møte mellom de to utenriksministrene, sa Nirupama Rao, talskvinne for det indiske utenriksdepartementet.
Tok hverandre i hånden
Pakistans president Pervez Musharraf og Indias statsminister Atal Behari Vajpayee tok hverandre i hånden da møtet i den sørasiatiske samarbeidsorganisasjonen SAARC åpnet i dag.
Forholdet mellom de to landene er svært spent etter angrepet på den indiske nasjonalforsamlingen i desember i fjor, der 14 mennesker ble drept.
India beskylder to militante grupper, som kjemper mot indisk styre i Kashmir og har baser i Pakistan, for å stå bak.