For første gang siden Kypros ble delt i 1974 stilte ikke veteranen Rauf Denktash, som har vært president siden 1976, til valg.
Ni andre kandidater kjempet om å lede utbryterregionen, deriblant statsminister Mehmet Ali Talat (53), som var klar favoritt.
Med godt over halvparten av stemmene trengs det ingen ny valgomgang. Hans fremste rival, Dervis Eroglu, fikk kun 22,7 prosent av stemmene.
Gjenforening
VANT VALGET: Påtroppende president Mehmet Ali Talat. Foto: AFP/Scanpix.
Talat har understreket at forhandlingene om gjenforening på grunnlag av en FN-plan må gjenopptas.
– Fred er det vi tenker mest på i dette valget, sa Talat da han møtte fram for å avgi stemme.
Valglokalene stengte kl. 17, og ifølge lokale nyhetsmedier hadde 65 prosent av de 148.000 registrerte velgerne avlagt stemme.
Det er ikke meldt om uroligheter under valgavviklingen.
Tidsalder forbi
Veteranen Denktash ville ikke stille til gjenvalg etter uoverensstemmelser med regjeringen i Ankara.
Tyrkia er det eneste landet som har anerkjent den tyrkisk-kypriotiske delen av middelhavsøya som egen stat, etter at tyrkiske militære styrker okkuperte den nordlige halvdelen i 1974.
– Dette valget betyr slutten på en tidsalder ettersom styret til Rauf Denktash nå er over, skrev den gresk-kypriotiske avisen Cyprus Mail.
Denktash var trofast mot sine nasjonalistiske idealer helt til det siste og levnet ingen tvil om hva han mener om Talat.
– Historien og det tyrkiske folk vil aldri tilgi deg hvis du selger deg til gresk-kypriotene, sa Denktash da han møtte fram for å stemme.
STILTE IKKE: 81 år gamle Rauf Denktash stilte ikke til valg, for første gang siden 1976. Foto: AP/Scanpix.
Talat leder det republikanske tyrkiske partiet CPT, mens hans argeste konkurrent, Eroglu, kommer fra Det nasjonale enhetspartiet.
Press på grekerne
En seier til Talat vil legge nytt press på den gresk-kypriotiske presidenten Tassos Papadoupolos for å få i gang nye forhandlinger om FN-planen for den delte øya.
Opplegget til FNs generalsekretær Kofi Annan var å få til en gjenforening av øya før EU-medlemskapet ble en realitet.
Men den planen gikk i vasken i april i fjor da gresk-kypriotene sa nei til en slik plan, mens tyrkisk-kypriotene stilte seg positive.
Talat sa for kort tid siden at han vil komme med en appell
til Papadoupolos om å sette seg ned ved forhandlingsbordet igjen for å finne en løsning på de politiske problemene som har preget Kypros de siste tiår.