Kampene har funnet sted torsdag og fredag i de oljeproduserende delstatene Al Wahdah og Øvre Nilen.
Det opplyser en Philip Aguer, en talsperson for Sør-Sudans SPLA-hær, til nyhetsbyrået AFP.
FN bekrefter at det var kraftige sammenstøt, men kan ikke bekrefte antallet drepte.
- LES OGSÅ:
– Harde kamper
Minst 30 soldater og elleve opprørere døde i sammenstøt som brøt ut torsdag morgen i Mayom-distriktet i Al Wahdah, opplyser talspersonen fra Sør-Sudan.
– Kampene var harde, men vi forfølger nå opprørerne, sier Aguer.
34 SPLA-soldater ble også skadd i sammenstøtene, ifølge talspersonen.
- LES OGSÅ:
Aguer sier at kampene startet etter et sammenbrudd i samtaler hvor opprørerne ble forsøkt overbevist om å slutte seg til Sør-Sudans hær.
I delstaten Øvre Nilen ble fire SPLA-soldater og 25 opprørere fra en annen militsgruppe drept, opplyser han. Aguer mener medlemmer av denne militsen står bak en dødelig raid i delstatshovedstaden Malakal forrige lørdag, da 25 opprørere og fire SPLA-soldater ble drept.
- LES OGSÅ:
Flere sammenstøt
Opprørskommandanten Ulony ble skadd, men antas å ha kommet seg over grensen til Nord-Sudan.
Delstatene Al Wahdah og Øvre Nilen ligger nær Sør-Sudans grense til det nordlige Sudan.
- LES OGSÅ:
Sør-Sudan har gjentatte ganger anklaget regjeringen i nord for å hjelpe opprørere med baser og våpen.
Det har vært en økning i antallet voldelige sammenstøt mellom opprørsgrupper og Sør-Sudans hær siden folkeavstemningen om Sør-Sudans uavhengighet i januar. Sørsudaneserne stemte nesten utelukkende for løsrivelse.
- LES OGSÅ:
