Redningstjenesten ved flyplassen meldte først at minst åtte var omkommet. Landets departement for luffart melder senere at 13 personer er bekreftet døde, ifølge nyhetsbyrået AFP.
Flere personer skal også ha blitt fraktet til sykehus med alvorlige skader.
Det er forskjellige opplysninger om hvor mange som var om bord. Redningstjenesten sier det var 20. Nigerias transportdepartement sier ifølge Reuters at det var 27.
Flyet krasjlandet rett etter at det hadde tatt av.
– Det var et fly fra flyselskapet Associated Airline. Det skulle til Akure, sørvest i landet. Motoren sviktet rett etter avgang. Flyet krasjlandet og styrtet i flammer, sier Supo Atobatele, talsmann for Nigerias luftfartsmyndighet.
Få siste nytt om ulykken i NRKs nyhetssenter.