Presidentens forslag blir sett på som en viktig politisk dreining i kampen mot landets ekstremt voldelige narkotikakrig.
Peña Nieto har lenge vært motstander av legalisering, men varsler nå en helt ny retning for landets narkotikapolitikk, skriver BBC.
Torsdag kunngjorde han regjeringens planer om legalisering.
– Landet vårt har lidd under krigen mot narkotika i 40 år. Meksikanere vet alt for godt hvordan politikken har sviktet på dette feltet. Vi har ikke klart å nedkjempe narkokrigen, sa presidenten.
- LES OGSÅ: Narko-leder pågrepet i Mexico
Over 100.000 har blitt drept i narkokrigen
Demonstranter har lenge krevd at mexicanske myndigheter må endre sin strategi i kampen mot landets narkotikabander.
I 2006 erklærte den nyvalgte presidenten Felipe Calderón krig mot narkotikakartellene ved å sende tusenvis av soldater for å pågripe hovedmennene.
Den gang sa den daværende presidenten nei til å legalisere narkotika.
Det fungerte dårlig. Tidligere utenriksminister Jorge Castañeda var blant kritikerne som mente krigen mot kartellene var en fiasko som bare førte til enorm lidelse for mexicanerne.
– Før ble Mexico sett på som landet i Latin-Amerika med størst mulighet til å bli et utviklet land, men nå er det et land der store regioner og institusjoner kontrolleres av de mektigste kriminelle på kloden, sa Castañeda den gang.
Siden har over 100.000 mennesker mistet livet i kampen mot narkobaronene. I tillegg har myndighetens militære kamper også utfordret institusjonenes troverdighet. Både politi, dommere og guvernører har blitt bestukket av de brutale bandene.
– Kriminalisering gjør vondt verre
Nå vil Enrique Peña Nieto reformere rusmiddelbrukens retningslinjer. Det åpnes opp for en utvidelse av dagens lovverk, men blir ikke en fulllstendig legalisering.
På pressekonferansen torsdag kveld varslet han endringer i lovverket. Mengden marihuana en person kan bære utvides fra fem til 28 gram.
I tillegg åpnes det opp for bruk av mariuhana i medisinsk sammenheng.
– Kriminalisering er ikke løsningen. Vi må ikke straffe de kriminelle, men tilby dem konstruktive alternativer og muligheter, sa presidenten.
Dermed føyer landet seg inn i rekken av land som delvis eller helt har legalisert Mariuhana. Bare i USA har 23 delstater legalisert stoffet medisinsk. En studie fra 2015 viser at mye av kriminaliteten forsvinner når et land legaliserer marihuana.
Peña Nieto håper verden følger etter.
– Heldigvis ser vi en ny konsensus globalt, der narkotikapolitikken reformeres i stadig flere land, og der man skjønner at straffeforfølgelse ikke løser alle utfordringene rundt rusmiddelet, sier han.
Samtidig understreker han at bruken av mariuhana likevel bør bli sett på som et folkehelseproblem.