Myndighetene mistenker at muslimske opprørere sto bak angrepet. Masseflukten er den mest omfattende på mange år, opplyser myndighetene.
Fengselsdirektør Peter John Bongat sier en vokter ble drept og en innsatt såret i skuddvekslingen som oppsto da titalls væpnede menn stormet fengselet i byen Kidapawan på Mindanao like før daggry onsdag.
5 innsatte døde
Ifølge fengselsdirektøren døde fem innsatte under angrepet.
Politi og soldater søker nå etter de mer enn 130 fangene som rømte. Politimesteren i Kidapawan, Leo Ajero, sier to av dem er pågrepet. En av dem som flyktet, ble tatt i en landsby i nærheten, der innbyggerne var vekket av skuddvekslingen ved fengselet.
– Vi hørte skytingen og forberedte oss på å forsvare landsbyen. Vi var redd rømlingene skulle prøve å komme hit og skjule seg, eller ta gisler, forteller landsbyleder Alexander Austria.
Årelang konflikt
Mindanao har vært åsted for en årelang konflikt mellom regjeringen og muslimske separatister og opprørere. Blant de mest kjente gruppene er Moro islamistiske frigjøringsfront (MILF) og islamistgruppen Abu Sayyaf.
I september i fjor ble norske Kjartan Sekkingstad sluppet fri etter å ha vært holdt som gissel av Abu Sayyaf i nesten et år.
Mistenker islamister
Ifølge Bongat mistenkes medlemmer fra Bangsamoro islamistiske frigjøringskjempere (BIFF) å være blant dem som sto bak angrepet. BIFF brøt ut av opprørsgruppa MILF i 2008, og er motstandere av fredsprosessen mellom MILF og myndighetene.
Det var over 1.500 fanger i fengselet, blant dem flere BIFF-medlemmer. På lik linje med Abu Sayyaf kjemper BIFF for en større og helt uavhengig islamsk stat. Begge gruppene har uttrykt støtte til terrorgruppen Den islamske staten.
Onsdagens angrep er det tredje mot et fengsel sør på Filippinene siden 2007.