Det melder nyhetsbyrået AFP.
– Påtalemyndigheten har i dag løslatt kapteinen og frafalt siktelsen. Kapteinen vil bli sendt tilbake til Kina, heter det fra det japanske nyhetsbyrået Koyodo.
Kapteinen har blitt holdt tilbake i Japan i to uker. Han ble beskyldt for å ha krasjet med to japanske kystvaktfartøy med fiskebåten sin.
Japan hevder kollisjonen ikke var en ulykke.
Arrestasjonen førte til at forholdet mellom Kina og Japan ble svært anstrengt.
Kina innstilte den bilaterale kontakten på regjeringsnivå med Japan. Kineserne krevde en ubetinget løslatelse av kapteinen, og truet med «en rekke alvorlige konsekvenser» dersom det ikke skjedde.