David Libai, som også er tidligere justisminister, tok oppdraget før anklagene om voldtekt og seksuell trakassering kom på bordet.
I en uttalelse fra presidentens kontor heter det at Katsav og Libai ble enige om at Libai skulle slutte for en uke siden.
Katsav tok permisjon fra presidentjobben etter at Israels riksadvokat sa at han vil ta ut tiltale mot ham.
En formell beslutning om tiltale vil bli tatt etter en høring der Katsav vil få anledning til å forsvare seg.