Kadyrov, som til nå har vært statsminister i Tsjetsjenia, erstatter Alu Alkhanov, som utnevnes til visejustisminister i Kreml, melder det russiske nyhetsbyrået Interfax.
Menneskerettighetsgrupper anklager Kadyrov for å stå bak kidnappinger og vilkårlige pågripelser av sivilpersoner som mistenkes for å stå i ledtog med tsjetsjenske opprørere.
Ivanov visestatsminister
Skiftet kommer samtidig som Russlands forsvarsminister Sergej Ivanov blir utnevnt til første visestatsminister med ansvar for deler av finanspolitikken.
Ivanov blir ansett som en av de fremste kandidatene til å bli president når Putin går av neste år. En annen favoritt er Dmitrj Medvedev, som også er visestatsminister.
Ivanov er KGB-veteran med over 20 års fartstid i etterretningsorganisasjoner og har mange kontakter i Russlands forsvars- og etterretningskretser.
Han snakker flytende engelsk og svensk og ble i 1983 utvist fra Storbritannia anklaget for spionasje.
Anatolij Serdjukov er utnevnt til ny forsvarsminister. Han har tidligere vært leder for den russiske skattemyndigheten.