Dermed ligger det an til at Japan snart får sin sjette statsminister på fem år.
Statsminister Kan ble sterkt kritisert etter jordskjelvet og atomulykken i Japan i vår, og har nå en oppslutning på under 20 prosent på meningsmålingene.
To omfattende lovforslag ble først vedtatt av nasjonalforsamlingen, deretter kunngjorde Kan sin avgang, noe han hadde lovet på forhånd.
De to lovpakkene som ble vedtatt fredag, dreide seg om fornybar energi og utstedelse av statsobligasjoner som skal dekke underskudd på statsbudsjettet.
Upopulær leder
Kan har vært statsminister i Japan siden 4. juni 2010. Han har også vært partileder leder i to perioder tidligere, først fra 1998 til 1999, og fra 2002 til 2004.
- Les også:
Minst sju kandidater kjemper om å som leder for DPJ. En etterfølger vil bli utpekt 30. august.
Partiet har flertall i nasjonalforsamlingens andrekammer, og vinneren vil trolig bli ny statsminister.
Kan, som bare har vært regjeringssjef i vel ett år, gjorde seg upopulær med sin håndtering av jordskjelvkatastrofen i mars i år, som førte til krisen ved atomkraftverket Fukushima-Daiichi nordøst i landet.
Kans etterfølger må blant annet håndtere problemene med den stigende kursen på landets valuta yen, som gjør japanske varer dyrere på eksportmarkedene, og en stadig økende statsgjeld.