Mandag trakk kardinalen seg som erkebiskop av St Andrews og Edinburgh etter anklager om at han på 1980-tallet kom med det som kalles «upassende oppførsel» overfor andre prester.
O'Brien innrømmer upassende seksuelt atferd i en pressemelding søndag, melder BBC.
– Jeg ønsker å bruke denne anledningen til å innrømme at jeg til tider ikke har opprettholdt den seksuelle atferd som ventes av meg som prest, erkebiskop og kardinal, sier kardinal Keith O'Brian.
– Jeg beklager og spør om tilgivelse overfor dem jeg har støtt. Jeg ber også Den katolske kirke i Skottland og Det skotske folk om unnskyldning, sier O'Brien videre.
- Les også:
Fire klaget inn O'Brien
Tre prester og en tidligere prest har klaget inn O'Brien overfor Vatikanet, avslørte den britiske avisen Observer forrige søndag.
Klagerne kommer fra to bispedømmer i Skottland, der O'Brien har vært erkebiskop.
De kritikkverdige forholdene skal angivelig ha pågått over en periode på over 30 år.
En av prestene skal selv ha hatt et «upassende forhold» til kardinalen-
Deltar ikke på konklavet
O'Brien trekker seg bare noen få uker før hans 75-årsdag, da han uansett skulle gått av som erkebiskop.
O'Brian var blant annet ventet å delta når kardinaler fra hele verden skal bestemme hvem som skal bli den katolske kirkens neste pave.
Etter at han trakk seg, gjorde han det også klart at han ikke kommer til å delta på konklavet som velger pave Benedikts etterfølger.
Kåret til «Årets mest fordomsfulle»
O'Brien har vært kjent som en forsvarer av den katolske kirkens standpunkter når det gjelder homoseksualitet.
Nylig uttalte han at ekteskap mellom personer av samme kjønn vil være «skadelig for den fysiske, mentale og spirituelle helsen til de involverte».
Organisasjonen Stonewall, som kjemper for homoseksuelles rettigheter, kåret i fjor kardinal O'Brien til «Årets mest fordomsfulle».