Mange soldater som er lojale til den nyutnevnte guvernøren er såret og ligger på sykehus etter kamper i Gardez (Foto: Enric Marti/AP-Scanpix)
De 40 drepte tilhørte styrkene til den nyutnevnte guvernøren i Paktia-provinsen øst i landet, Padsha Khan.
Og væpnede grupper under ledelse av en annen kommandant, Saif Ullah, har trengt inn i guvernørboligen i provinshovedstaden Gardez i protest mot utnevnelsen av Khan, ifølge øyenvitner.
Guvernørens egne styrker skal ha forsøkt å omgruppere utenfor byen.
Kan ha drept 300 fanger
Saif Ullah, som overtok kontrollen i Pakitaprovinsen etter at Taliban var jaget ut i fjor høst, kan ha tatt livet av opp til 300 fanger de siste 48 timene, ifølge den nye guvernørens bror.
- Etter at de ble tatt til fange, begynte Saif Ullahs styrker å drepe dem, sier han. Opplysningene er ikke bekreftet.
Kampene brøt ut i går da den nye guvernøren kom for å heise det nye afghanske flagget over guvernørboligen. Padsha Khan tok kontroll over det meste av byen, men klarte ikke å innta politistasjonen og et gammelt fort.
Karzai svak
Khans styrker forbereder i dag et angrep mot fortet etter å ha blitt forsterket med tyngre våpen fra byen Khost, men den nye guvernøren har liten tro på hjelp fra den som innsaate ham.
På spørsmål om den nye guvernøren venter forsterkninger fra Kabul, svarer broren at Karzai ikke har noen makt utenfor hovedstaden.
- Vi trenger ikke Karzais styrker. Han er meget svak, han kan ikke gjøre noe for oss. Han har ikke engang mye makt i Kabul, og vi vil løse disse problemene lokalt, sa guvernørens bror. Amerikanske kampfly har sirklet over Gardez de siste dagene, men har ikke deltatt i de interne afghanske kampene.
Utfordring
En regjeringssoldat ransaker en landsbybeboer på vei til Paktia-provinsen (Foto Amir Shah/AP - Scanpix)
Hvis flere hundre mennesker er blitt drept i oppgjøret mellom de rivaliserende gruppene, er det en alvorlig utfordring for den midlertidige regjeringen i Kabul.
Den internasjonale styrken i Afghanistan har ingen mulighet til å roe situasjonen. Styrken består av bare 4.500 mann som alle er utplassert i Kabul-området.
Karzai sa i New York i går at det internasjonale samfunnet må sende flere soldater til Afghanistan, ettersom en stabil sikkerhetssituasjon er en forutsetning for den økonomiske gjenoppbyggingen.
- Vi håper dere vil tillate en utvidelse og en forlengelse av de internasjonale styrkenes mandat, sa Karzai i en tale i FNs sikkerhetsråd.