Det sier israelske militærkilder til nyhetsbyrået AFP.
Den drepte er regnet som den øverste Hamas-lederen på Vestbredden.
Ifølge israelske militære skjøt de mannen fordi han forsøkte å stikke av de skulle arrestere han.
Israel mener han er hovedmannen bak fem selvmordsaksjoner i Israel, inkludert et angrep på en buss 11. juni i år, der 18 mennesker ble drept.