Mannen ble funnet død onsdag i den ugandiske byen Entebbe ved Victoriasjøen, skriver lokale medier.
Utenriksdepartementet bekrefter at den døde mannen var norsk.
– Vi kan bekrefte at en norsk statsborger, rundt 60 år gammel, er død i Uganda. De pårørende er varslet, sier pressevakt Kjetil Elsebutangen til NRK.
Nordmannen jobbet tidligere for FN i nabolandet Kongo, men ble pensjonist i februar. Han ble funnet død onsdag morgen av sin faste sjåfør.
En kvinne som skal ha tilbrakt natten hos nordmannen, er pågrepet, opplyser etterforskningsleder Fred Wetaya i Entebbe-politiet til ugandiske medier.
Mannen vil bli obdusert ved et lokalt sykehus.