Than Shwe var ikke oppført på listen over kandidater, men dette er første gang det bekreftes at han ikke vil stille, melder nyhetsbyrået AP.
Mange tror nå at Than Shwe vil bli landets neste president, en stilling som ikke velges av folket.
Valget skal være et ledd i en demokratisering av Burma, men kritikere tror juntaen, som har styrt i over 50 år, fremdeles vil beholde makten.
Nektet å gi fra seg makten
Det foreløpig siste valget på ny nasjonalforsamling i Burma ble holdt i 1990. Det endte med seier for demokratiforkjemperen Aung San Suu Kyis parti Nasjonalligaen for demokrati NLD, men de militære nektet å gi fra seg makten til Suu Kyi.
Les også:
– Suu Kyi kan bli løslatt
Samtidig som nyheten om juntalederen ble kjent, kommer det også nye signaler om at demokratiforkjemper Aung San Suu Kyi kan bli løslatt etter valget i november.
Det er Burmas utenriksminster som skal ha antydet dette. En kilde i delegasjonen til et av de andre landene opplyste om dette på en konferanse i Vietnam til nyhetsbyrået AFP.
Den burmesiske utenriksministeren Nyan Win skal ha fortalt asiatiske kolleger at Suu Kyi kanskje vil bli løslatt fra husarrest etter valget. Han oppga imidlertid ikke noen dato for når hun kan bli frigitt.