Det meldes om i alt fire eksplosjoner, ifølge nyhetsbyrået AFP. Bombene gikk av i morgenrushet på tre ulike stasjoner.
Reuters melder at minst én person er såret av en hjemmelaget bombe på en stasjon, mens en privat TV-stasjon siterer kilder som sier at tre personer har fått lettere skader i en eksplosjon på stasjonen Shubra El-Kheyma.
Blant stasjonene som ble rammet, er Ghamra i Kairo sentrum og Shubra El-Kheyma nord i hovedstaden. På Ghamra var bomben plassert i en søppeldunk, opplyser en tjenestemann i innenriksdepartementet.
Bombene skal ha vært primitive og hatt liten sprengkraft, ifølge en politikilde.
Egypt har opplevd en rekke angrep siden hæren avsatte den folkevalgte, islamistiske presidenten Mohamed Mursi i juli i fjor.
Da tidligere hærsjef al-Sisi ble tatt i ed som landets nye president tidligere i juni, lovet han å gjeninnføre ro og orden i landet.
