Brannen brøt ut rundt klokka fire på natten, mens mesteparten av passasjerene sov.
Det var en passasjervogn med 72 personer ombord som ble hardest rammet.
– Brannen sperret den ene døra i togvognen, så alle måtte skynde seg mot den andre utgangen, sier en lokal tjenestemann til nyhetsbyrået AP.
47 personer skal ha omkommet i brannen og 28 skal være skadd. Det er ventet at dødstallene vil stige.
Årsaken til brannen er ikke klar, men enkelte medier melder at det kan ha skjedd en elektrisk kortslutning.
Toget var på vei fra New Dehli til den sørøstlige byen Chennai. Brannen brøt ut da toget kjørte gjennom byen Nellore i delstaten Andhra Pradesh.
I mai i år omkom 24 personer da et passasjertog kolliderte med et godstog i den samme delstaten.
I løpet av de siste fem årene har 1.220 mennesker mistet livet i togulykker i India, ifølge BBC.
- Les også: