Et øyevitne sier han så tolv lik i et likhus i et sykehus i byen, og at alle skal ha mistet livet døde under opptøyene.
- Noen av dem er politimenn, sa en politikilde som ikke ville navngis. En annen polititjenestemann sa de ventet at flere døde ville komme til sykehuset.
Tidligere i dag sa bistandsarbeidere at situasjonen i Sudan er ute av kontroll etter at tusenvis av sudanere i morges mandag plyndret butikker i Khartoum etter at nyheten om visepresident John Garangs død var blitt kjent.
Mange av dem som deltok i opptøyene, var væpnet med kniver og brekkjern. Butikkene i sentrum av Khartoum stengte sine dører, og det kunne høres skyting, fortalte folk i byen til nyhetsbyrået Reuters.
– Folk løper rundt i gatene, og noen blir plukket opp av politiet som tar dem med seg. Alle med arabisk utseende risikerer å bli banket opp, sa en student.
John Garang beskrives som den ubestridte lederen av det overveiende kristne Sør-Sudan, mens de nordlige delene av landet domineres av arabere.
Fram til fredsavtalen mellom Nord- og Sør-Sudan i januar, var han en av de viktigste lederne i Afrikas mest langvarige borgerkrig. 9. juli ble han innsatt som visepresident.
Nyheten om hans død satte svært sterke følelser i sving i Khartoum.
– Situasjonen er helt ute av kontroll, biler brennes, banker ranes, og det kommer stadig meldinger om skyting, sa pressekontakt Arne Grieg Riisnæs i Kirkens Nødhjelp til NTB mandag.
Sørsudanere i Khartoum sørger i dag over Garangs død (Scanpix/AP)
– Reaksjonene var først preget av sorg, som så gikk over i sinne, fortalte Riisnæs etter å ha vært i kontakt med Kirkens Nødhjelps folk i Sudan.
– De er tett inne på begivenhetene, og føler seg naturlig nok ikke trygge, tilføyde han. Han kunne ikke svare på om det blir aktuelt å trekke organisasjonens medarbeidere ut av Sudan.
Vestlige ambassader i Khartoum ba sine lands statsborgere om å holde seg hjemme og innendørs. Samtidig ble det meldt om uro også i det store sørsudanske befolkningssenteret Juba og i den mindre byen Yei.
Ifølge den britiske rikskringkastingen BBC forsøkte sikkerhetsstyrker ved middagstider mandag fortsatt å gå kontroll over sentrum av den sudanske hovedstaden. De utkjempet rene gateslag med gjenger av sørsudanske ungdommer, het det i denne melding
Landesorg
Garang døde etter at helikopteret hans styrtet da det var på vei fra Uganda til Sudan søndag kveld, og det ble mandag erklært landesorg i tre dager.
Samtidig sa Sudans president Omar Hassan al-Bashir at han vil fortsette fredsprosessen som Garang sto i spissen for.