I alt seks personer var involvert i ulykken, men bare 37-åringen ble fløyet til St. Olavs hospital i Trondheim med luftambulanse.
Han måtte først skjæres løs fra bilen, men var våken og stabil da han ble frigjort.
De øvrige fem ble sendt til legevakten i Stjørdal for kontroll.
– Det var fem mennesker i den ene bilen og én i den andre, sier operasjonsleder Ole Tuseth i Trøndelag politidistrikt til NTB.
Politiet fikk beskjed om ulykken via AMK-sentralen klokka 13.47 søndag.
Kollisjonen skjedde like ved en planovergang, men tog kunne passere forbi ulykkesstedet med redusert hastighet.
– Vi regner med at de kom ifra hver sin retning i t-krysset, sier politiets innsatsleder, Solveig Eide til NRK.