Simoni ble bare nummer 18 på den 40 kilometer lange etappen som ble vunnet av ukrainske Sergej Gontsjar.
Simoni kunne juble etter seieren.
Simoni vant også Giro i 2001, men i fjor var han utestengt for kokainbruk.
Hans neste store oppgave blir å ta opp kampen med Lance Armstrong i Frankrike rundt som starter 5.juli.
Spenningen foran siste etappe dreide seg om annenplassen sammenlagt, der kampen sto mellom italieneren Stefano Garzelli og ukraineren Jaroslav Popovitsj.
Foran siste etappe skilte to sekunder. Garzelli trakk det lengste strået og slo Popovitsj med ett sekund på tempoetappen.
Resultater
21. og siste etappe, 33 km tempo:
1) Sergej Gontsjar, Ukraina (De Nardi) 38.04,
2) Marzio Bruseghin, Italia (Fassa Bortolo) 0.19 min. bak, 3) Aitor Gonzalez, Spania (Fassa Bortolo) 0.20,
4) Dario Frigo, Italia (Fassa Bortolo) 0.26,
5) Raimondas Rumsas, Litauen (Lampre) 1.03,
6) Sandy Casar, Frankrike (FdJeux) 1.05,
7) Stefano Garzelli, Italia (Vini Caldirola) 1.16,
8) Leonardo Bertagnolli, Italia (Saeco) 1.18,
9) Jaroslav Popovitsj, Ukraina (Landbouwkrediet) 1.19,
10) Georg Totschnig, Østerrike (Gerolsteiner) 1.21.
Sluttstilling:
1) Gilberto Simoni, Italia (Saeco) 89.32.09,
2) Garzelli 7.06 min. bak,
3) Popovitsj 7.11,
4) Andrea Noe, Italia (Alessio) 9.24,
5) Totschnig 9.42,
6) Rumsas 9.50,
7) Frigo 10.50,
8) Gontsjar 14.14,
9) Franco Pellizotti, Italia (Alessio) 14.26,
10) Eddy Mazzoleni, Italia (Vini Caldirola) 19.21.
Kategorivinnerne:
Sammenlagtvinner (rosa ledertrøye): Simoni.
Poengvinner: Simoni
Beste klatrer: Fredy Gonzalez Martinez, Colombia (Selle Italia)
Intergiro-spurter: Magnus Backstedt, Sverige (Team fakta)
Beste lag (tid): Lampre (Italia)
Beste lag (poeng): Fassa Bortolo (Italia)