Thorkildsen kastet 85,18, men var over tre meter bak vinneren, finske Tero Pitkämäki.
Finnen kastet 88,27 meter og fikk dermed revansj fra EM i Göteborg.
- Jeg var ikke 100 prosent i kveld. Teknikken satt ikke helt, sa Thorkildsen til NRK.
Gullpotten røk
Dermed har spydkonkurrentene to seirer hver i årets Golden League.
Begge er dermed ute av kampen om gullpotten.
Latviske Vadims Vasilevskis ble nummer tre 82,50.