Powell vant sin semifinale klart med 9,96, men sto over finalen.
Han ville spare energi til superduellen med verdensrekordholder Usain Bolt i kommende helgs Jamaica-mesterskap.
-Jeg var litt nervøs med tanke på at det regnet og at det var mitt første løp etter skade, sa Powell som løp under 10 sekunder for 34. gang i karrieren.
Den tidligere verdensrekordholderen deltok i Trinidad-mesterskapet i helgen.
Powell skadet sin høyre skulder da han løftet vekter i april.