25-åringen vant på tiden 43,80, 2,25 sekunder foran spanske Teresa Perales på sølvplass.
Hviterussiske Reka Kezdi tok bronse.
Den norske 25-åringen var regjerende mester på distansen.
Jakter medaljer
Dette er Rungs andre gull på to dager i svømme-VM for funksjonshemmede. Onsdag tok hun gull på 200 meter fri.
Da la hun ikke skjul på at hun hadde mål om flere medaljer i mesterskapet.
– Jeg har jo et ønske om å hele tiden være på topp og prøve å forbedre sine tider. Det er noe jeg alltid har lyst å strekke meg etter, prøve å utvikle seg og holde de andre bak seg, sa Rung til NRK da.
Niende VM-gull
Torsdag kom det altså, nå står svømmeren med totalt tre medaljer i mesterskapet. På mandag tok hun bronse på 50 meter rygg, noe som er en atskillelig mer uvant øvelse for den norske svømmeren enn de to hun har tatt gull på.
Torsdagens seier var for øvrig Rungs niende i VM-sammenheng.