Han er også vraket fra det amerikanske laget til neste års VM i svømming.
Phelps er tidenes mestvinnende olympier med sine 18 OL-gull.
Phelps ble nylig arrestert for promillekjøring for annen gang og mandag kom Det amerikanske svømmeforbundet med sin reaksjon
Tar pause
Samtidig har svømmestjernen gjort det klart at han i alle tilfeller har bestemt seg for å ta en pause fra sporten.
Det er på sin Twitter-konto Michael Phelps nå forteller omverdenen om sin plan for å komme på rett kjøl igjen.
– Svømming er en stor del av livet mitt, men akkurat nå må jeg bruke kreftene mine på meg selv som menneske å gjøre den jobben som trengs for å lære av dette og ta bedre avgjørelser i fremtiden, skriver Phelps.
– Utrolig skuffet
Phelps har 18 OL-gull og er med det tidenes mestvinnende olympier, men 29-åringen har også havnet i usportslig fokus for cannabis-bruk og fyllekjøring.
For fem dager siden ble han tatt for fyllekjøring for andre gang i karrieren. Phelps ble stoppet på motorveien i 135 kilometer i timen i 70-sonen og arrestert av Baltimore-politiet med dobbelt så høy promille som lovlig.
Phelps ble stoppet av politiet med alkohol i blodet mens han satt bak rattet også i 2004.
– De siste dagene har vært veldig vanskelige. Jeg erkjenner at dette ikke er første gang jeg havner i trøbbel og jeg er utrolig skuffet over meg selv.
– Jeg kommer til å ta en pause for å delta på et program som vil gi meg den hjelpen jeg trenger, skriver Phelps.
Satser mot Rio
I tillegg til promillekjøringene har svømmestjernen også skapt kontroverser med sin cannabis-bruk. I 2009 gikk han offentlig ut og beklaget etter at bilder av han som røyket cannabis dukket opp i media.
Phelps har sagt at han satser for fullt mot OL i Rio de Janeiro i 2016.
Her er Twitter-kommentarene Phelps nå har lagt ut:
