Nordhaug, som kjørte sterkt og godt hele veien, var 16 sekunder bak vinneren på toppen.
Han rykket opp på 6.-plass sammenlagt og ligger 28 sekunder bak Rodriguez som leder.
Katjusja-seier
Det var Katjusja-rytteren Joaquim Rodriguez som gikk til topps på etappen, etter at han rykket kraftig i den siste bakken opp mot mål.
Feltet sprakk fullstendig opp da spanjolen rykket, og han kjørte inn til seieren i ensom majestet.
Samuel Sanchez tok annenplassen. Han var ni sekunder, og deretter kom rytterne inn en og en og to og to i det som kalles rittet kongeetappe.
Ikke langt opp til pallen
Det skiller ikke mer enn sju sekunder mellom Nordhaug, som kjører for Sky-laget, og amerikanske Christopher Horner som ligger på tredjeplassen.
Baskerland rundt, som rittet ofte kalles på norsk, avsluttes lørdag.