Den tidligere verdensrekorden var på 12,87 - altså sju hundredeler svakere enn Merritts utrolige rekordløp fredag kveld.
Den forrige verdensrekorden tilhørte Dayron Robles fra Cuba, satt i tsjekkiske Ostrava 12. juni 2008.
Merritt var helt overlegen i løpet. 2.-plassen gikk til landsmannen Jason Richardson på 13,05.
– Jeg prøvde bare å komme meg under 13 blank, slik at det ble en bra avslutning på sesongen. Jeg kan ikke fatte at jeg klarte å løpe så fort. Hva for en tid er det jeg ser på tavla? Jeg er i sjokk, fleipet Merritt.
Årets desidert beste
27 år gamle Merritt har vært øvelsens suverent bestemann gjennom hele sesongen, og han tok også OL-gull i London i sommer.
– Det er først denne sesongen at jeg har fått det til å stemme. Det er min beste sesong noen gang.
Han er en utøver som hele tiden har tatt steg for steg. I VM i 2009 klarte han ikke å kvalifisere seg til finalen. I VM-finalen i sørkoreanske Daegu i 2011 endte han på 5.-plass.
Enkel seier for Bolt
Usain Bolt hadde små problemer med å vinne årets siste 100-meter. Tiden var det imidlertid ikke Bolt-klasse over, jamaicaneren løp «bare» på 9,86.
Se Bolts løp her:
Jamaicanske Yohan Blake løp 200-meter i kveld. Han vant på tiden 19,54.