Det opplyser Ugandas friidrettsforbund i en uttalelse torsdag.
Ifølge rapporter fra lokalt politi var så mye som 75 prosent av kroppen hennes påført brannskader, melder blant annet ESPN og nyhetsbyrået AP.
– Vi er dypt triste over å måtte meddele bortgangen til vår utøver, Rebecca Cheptegei, tidlig i morges, står det i meldingen, skriver Ugandas friidrettsforbund i uttalelsen.
Hendelsen skal ha funnet sted i Kenya, der 33-åringen bodde og trente.
Ifølge internasjonale medier, den kenyanske avisen The Standard og Nation Africa, så mener kenyansk politi at det var kjæresten som skal ha stått bak hendelsen.
– Trist
Hendelsen skal ha skjedd i Cheptegeis hjem. Tirsdag skrev blant annet BBC at politiet har iverksatt etterforskning og sikret bevismateriale på stedet. Ifølge Nation Africa fant politiet blant annet en stor plastdunk, samt en brent mobil på åstedet.
Cheptegei deltok i OL i Paris, der hun løp maraton og endte på 44.-plass.
– Det var trist å lese om Rebecca Cheptegei, sier NRKs kommentator Jann Post.
– Løping er en solid inntektskilde i fattige strøk i Afrika og mange ønsker en del av disse inntektene. Det har ført til grov vold, krangler og utnytting. Noe blant annet podkastserien til Sveriges Radio «Löparkriget» belyste tydelig.
Ny tragedie
Hendelsen i Kenya er ikke den første tragedien som rammer maratonverden i år. I februar døde verdensrekordholder Kelvin Kiptum i en tragisk bilulykke.
Kenyaneren ble den første mannen som løp et rekordtellende maraton på under 2 timer og ett minutt.