Ti tjenestefolk fra et etterforskningsteam i Brandenburg startet ransakelsen tidlig på morgenen.
Avisen Berliner Morgenpost skriver at en tilsvarende razzia er gjennomført hos Helge Jasch. Han er en av topplederne i tysk skøytesport.
Etterforskningsledelsen håper å finne spor som kan avsløre bakmenn som er involvert i dopingsaker.
- Det er selvfølgelig en guffen følelse når huset blir ransaket, alle skuffer åpnet og PC-er sjekket. Men likevel er jeg glad det er gjort, sier Pechstein.
Veteranen Pechstein ble utelukket fra sport i to år på grunn av mistenkelige verdier i blodprofilen.
Hun har aldri avgitt en positiv dopingprøve.
Fem OL-gull
Ingen tysk vintersportsutøver har vunnet så mye i OL som den femdobbelte gullvinneren, men i kampen for deltakelse i Vancouver har hun gått fra tap til tap etter at hun i fjor ble utestengt for doping på grunnlag av unormale blodverdier.
Etter å ha tapt i Idrettens voldgiftsrett i fjor høst, tok hun saken til sivil sveitsisk rett og tapte igjen.
Så fikk hun den stående CAS-domstolen, som samles under olympiske leker for å ta seg av hastesaker, til å se på saken i håp om å rekke OL, til ingen nytte.