Den 165,5 kilometer lange etappen fra Fleurie til Saint-Etienne inneholdt blant annet et fjell i første kategori, og da ble det for tøft for nordmannen.
Finske Kjell Carlström fra Liquigas vant foran franske Clement Lhotellerie. De to kom sammen mot mål etter å ha ligget lenge lenge i brudd.
Hushovds lagkamerat i Credit Agricole Pierre Rolland ble nummer tre da han vant spurten blant de neste 15 tytterne som kom i mål 42 sekunder etter vinneren.
Franske Sylvain Chavanell kom i den samme gruppen og overtok ledelsen sammenlagt, han er nå to sekunder foran Karsten Kroon fra Nederland.
Hushovd kom inn neste 16 minutter bak vinneren. Og selv om han trolig er ute av kampen om den gule ledertrøya, har han fortsatt den grønne poengtrøya.
På torsdagens 176 lange etappe starter rytterne i Motelimar og avslutter på toppen av Mont Ventoux.
Etapperittet Paris Nice på sykkel onsdag:
3. etappe, 165,5 km Fleurie Saint-Etienne:
1) Kjell Carlström, Finland (Liquingas) 4.39.14
2) Clement L'Hotellerie, Frankrike (Skil-Shimano) samme tid
3) Pierre Rolland, Frankrike (Credit Agricole) 0.43 min. bak
4) Davide Rebellin, Italia (Gerolsteiner) s.t.
6) Rinaldo Noctentini, Italia (AG2R) s.t.
7) Robert Gesink, Nederland (Rabobank) s.t.
8) Damiano Cunego, Italia (Lampre)
9) Luis Sanchez, Spania (Caisse d'Epargne) s.t.
10) Gorka Verdugo, Spania (Euskatel-Euskadi) s.t.
Norsk: 82) Thor Hushovd (Credit Agricole) 17.06.
Sammenlagt:
1) Sylvain Chavanel, Frankrike (Cofidis) 12.37.01
2) Karsten Kroon, Nederland (CSC) 0.02 min bak
3) Sanchez 0.03
4) Verdugo 0.08
5) Rebellin 0.14
6) Juan Manuel Garate, Spania (Quick Step) 0.18
7) Jaroslav Popovitsj, Ukraina (Slipstream) 0.19
8) Nocentini 0.21
9) Gesink s.t.
10) Andrej Jefimkin, Russland (Quick Step) 0.34.
Norsk: 45) Hushovd 15.53.
Rittet fortsetter torsdag med 4. etappe på 176 km fra Montelimar til Mont Ventoux. Paris Nice avsluttes søndag.