Bøkko var på forhånd én av favorittene før dagens 1500-meter, men nordmannen klarte ikke å innfri sine egne forventninger.
26-åringen gikk i siste par med polske Zbigniew Brodka, og Bøkko slet allerede fra start.
- Se resultater i faktaboks til høyre!
Russisk overraskelse
Etter å ha haltet bak polakken i samtlige runder, gikk Bøkko inn til 11.-plass med tiden 1.48,24.
– Dette er en gedigen skuffelse, sier NRKs skøytekommentator Ove Eriksen.
Russiske Denis Juskov fosset inn til et noe uventet VM-gull på tiden 1.46.32, karrierens første VM-gull.
Han var 0,51 sekunder foran amerikanske Shani Davis, som tok sølv. Ivan Skobrev sikret bronsen for Russland.
Lunde Pedersen beste nordmann
Det andre norske VM-håpet, Sverre Lunde Pedersen, gikk inn til 5.-plass med tiden 1.47,44. Pedersen var et snaut halvsekund fra sin første VM-medalje.
Christoffer Fagerli Rukke endte på 24.-plass med tiden 1.50,82.
1500-meteren var åpningsdistansen i VM i enkeltdistanser i Sotsji.
Gull til Irene Wust
På kvinnenes 3000 meter ble Ida Njåtun nummer 14 med 4.14,82. Ireen Wust fra Nederland tok gull på 4.02,43, mens sølvet gikk til tsjekkiske Martina Sablikova.
Hun ble slått med 2,37 sekunder. Tyske Claudia Pechstein fikk bronse. Mari Hemmer gikk på 4.21,41 og ble nummer 22.
Fredag fortsetter mesterskapet med 1000- og 5000-meter for menn, og 1500-meter for kvinner.