Spillere og trenere skal ha barket sammen i spillertunnelen på Old Trafford etter Uniteds 2-0-seier over Arsenal på Old Trafford søndag.
Ferguson fortalte på en pressekonferanse at United har igangsatt en egen etterforskning av saken. Ifølge britiske medier kastet en Arsenal-spiller mat på Ferguson etter kampen.
Vi har startet vår egen etterforskning av saken og samler sammen informasjon, sa Ferguson.
En rekke vitneutsagn er kommet, og vi kommer til å sende vår rapport videre til Det engelske fotballforbundet og overlate saken til dem, sa han.
FA opplyste allerede mandag at de ville granske hendelsene. To sene United-mål gjorde at Arsenal ikke klarte å spille sin 50. strake seriekamp uten tap.