Fabio Capellos lag har dermed fire seirer av fire mulige, og en klar ledelse i VM-kvalifiseringsgruppe 7.
England tok kommandoen fra start,og var i ledelsen etter et langskudd fra Steven Gerrard etter bare 11 minutters spill.
Hjemmelaget kom tilbake, og Pavel Sitko utliknet da han avsluttet et meget godt oppbygd angrep.
Utlikningen var fortjent på det tidlpunkt, men det var etterhvet England som viste seg klart best.
Avgjørelsen var det ikke uventet Rooney som stod bak. Fem minutter etter pause skjøt han hardt og lavt i mål, og kvarteret før full tid satte han inn 3-1.
England har 12 mål på sine tre siste kamper, fem av dem ved Rooney. Og de har fått sin beste start på en VM-kvalifisering noensinne.