Emile Heskey sendte vertene i ledelsen allerede etter to minutter.
Den tidligere landslagsspilleren traff godt på crossen fra Emmerson Boyce og skjøt forbi Nicky Weaver i City-målet.
Bare to minutter senere var City ille ute igjen da Richard Dunne satte ballen i eget mål.
Scharner headet over
Paul Scharner burde ha økt Wigans ledelse etter en drøy halvtime, men headet over mål.
I stedet gjorde Henri Camara 3-0 etter 65 minutter.
To minutter senere fastsatte Luis Antonio Valencia sluttresultatet til 4-0 med sin første scoring for klubben.
Det var Wigans annen seier denne sesongen.