Igor Biscan ble britenes syndebukk. Kroaten rev ned Steve Marlet innenfor 16-meterfeltet etter bare 36 minutters spill og tvang Marseille-spilleren til å skyte utenfor.
Rødt kort og straffespark knuste Liverpool-håpet om avansement til kvartfinale.
Didier Drogba, som scoret Marseilles mål i den første åttedelsfinalen, var sikker fra 11-meteren og sørget for 1-1 etter at Emile Heskey hadde gitt gjestene ledelsen 15 minutter ut i kampen.
Med ti mann på banen kom engelskmennene bakpå, og etter 58 minutters spill avgjorde Aboudlaye Meite på corner. Meite ruvet blant Liverpool-forsvarerne og stanget inn vinnermålet bak en sjanseløs keeper Jerzy Dudek.
Marseille er det første laget som har slått Liverpool som bortelag i UEFA-cupen siden britene tapte for Celta Vigo i 1998. John Arne Riise spilte hele kampen for Liverpool.
Newcastle fikk en enkel runde mot Mallorca. Det engelske laget hadde 4-1 å gå på fra hjemmekampen, og slo til med seier 3-0 borte torsdag. Newcastle er eneste engelske lag igjen i UEFA-cupen.
Anderson sendte ut Roma
John Carew satt på benken da Roma røk ut, selv etter 2-1-seier hjemme over spanske Villarreal.
Det spanske laget vant 2-0 hjemme og går videre med 3-2 sammenlagt.
Emerson og Antonio Cassano sendte Roma opp i 2-0-ledelse, før brasilianske Sonny Anderson reduserte midtveis i 2. omgang. Det holdt til avansement til kvartfinale for gjestene.
Noen minutter før slutt ble Roma redusert til ti mann etter at Jonathan Zebina så rødt. John Carew ble sittende på benken gjennom hele kampen.
Brugge utslått
Trond Sollieds belgiske klubb Brugge klarte heller ikke å gå videre. Etter 0-1-tap hjemme for franske Bordeaux torsdag og 1-4 sammenlagt til franskmennene.
Maruane Chamakh ble matchvinner etter 85 minutters spill. Han var en trussel gjennom hele kampen mot Brugges 39- årige keeper Dany Verlinden.
Bengt Sæternes spilte hele kampen for Brugge, mens Rune Lange ble byttet ut etter 67 minutter. Sæternes hadde vertenes beste sjanse like før pause etter at Gert Verheyens forsøk hadde falt rett i føttene på Sæternes. Men nordmannen skjøt over.
Bordeaux forsvarte seg godt og fortjente plass i kvartfinalen.
UEFA-cupen fotball torsdag, 4. runde 2. kamp:
Brugge (Belgia) – Bordeaux (Frankrike) 0-1, sammenlagt 1-4,
PSV Eindhoven (Ned.) – Auxerre (Fra.) 3-0, sammenlagt 4-1
Roma (Italia) – Villarreal (Spania) 2-1, sammenlagt 2-3
Barcelona (Spania) – Celtic (Skott.) 0-0, sammenlagt 0-1
Inter (Italia) – Benfica (Portugal) 4-3, sammenlagt 4-3
Marseille (Fra.) – Liverpool (England) 2-1, sammenlagt 3-2
Mallorca (Spania) – Newcastle (Engl.) 0-3, sammenlagt 1-7
Valencia (Spa.) – Gençlerbirligi (Tyr.) 2-0 eo., sml. 2-1