Hartlepool, som spiller på nivå tre i England, tok ledelsen fire minutter ut i annen omgang da Matty Robsons presise frispark fant hodet til Michael Nelson som stanget inn 1-0 fra kort hold.
Hjemmelaget doblet ledelsen et kvarter før slutt da David Foley sendte i vei en nyttårsrakett fra snaut 30 meter som keeper Steve Simonsen bare hørte lyden av.
Det er ikke første gang Hartlepool stikker kjepper i hjulene på eliteserielag denne sesongen. I august danket de ut West Bromwich i ligacupen.