Sammenlagt ble det 3-2-seier til Lyon, som dermed avanserer til semifinale i mesterligaen for første gang. Om to uker er Bayern München motstander.
- Vi var under ganske stort press i første omgang, men etter pause klarte ikke Bordeaux å holde rytmen helt, sa Lyon-trener Claude Puel.
Bordeaux måtte vinne med to mål hjemme på Stade Chaban-Delmas, og tok ett skritt på veien da Marouane Chamakh satte inn 1-0 rett før pause.
Laurent Blancs regjerende franske mestre holdt presset oppe også i andre omgang, men uten å få uttelling på sjansene.
Ludovic Sane nikket utenfor på hjørnespark fra Yoann Gourcuff, mens Wendel tvang Lyon-keeper Hugo Lloris til en superredning.
Takket keeperen
- Keeperen vår holdt oss inne i kampen ved et par anledninger, mente Puel.
I sluttminuttene kjørte Bordeaux opp alt av mannskap, men Lyon holdt stand og sikret plass i semifinalen. Tidligere har Lyon røket ut i kvartfinalene i 2004, 2005 og 2006.
Laurent Blanc mente at Bordeauxs tap i første rekke kom av uerfarenhet i det første oppgjøret.
- Det kostet oss minst to mål i kampen i Lyon. Vi var rett og slett ikke gode nok, og vi møtte et meget sterkt lag, sa Bordeaux-treneren.